开题报告内容:(包括拟研究或解决的问题、采用的研究手段及文献综述,不少于2000字)
- 选题依据及研究意义:
泛素特异性蛋白酶(USP)是去泛素化酶(DUBs)家族中最大的一类,同时在目前的研究领域也比较深入,其中USP7与肿瘤所致的癌症等疾病有着非常紧密的联系,抑制USP7可以有效的抗肿瘤,USP7抑制剂按照化学结构主要分为以下四类[1]:氰基茚并吡嗪类、吡咯酮类、9-氯四氢吖啶酰胺类及噻吩类。但是至今USP7抑制剂的研究还未成熟,还需要进一步的深化,所以此次研究课题以USP7为抗肿瘤靶点旨在研究USP7抑制剂的构效关系与结构修饰以及设计合成路线。
- 采用的研究手段
- 文献研究法:查阅文献,搜集课题相关的资料,从而全面地、准确地掌握所要研究的问题,为实验研究做准备。
- 实验法:进行具体实验并记录有效数据并得出结论。
- 实证研究法:根据现有的科学理论与实践需要,利用科学仪器和设备进行研究。
- 文献综述
泛素-蛋白酶体系统(UPS)是细胞中大部分蛋白质降解的主要途径。蛋白质接受了泛素化信号后,通过一系列的泛素化酶作用后,靶蛋白被泛素链标记,然后进入蛋白酶体降解,此时泛素从蛋白质上释放重新利用,参与到下一次的蛋白质降解过程中。近年来有研究[2]表明,泛素化过程可逆,去泛素化酶能够水解泛素和蛋白质之间的硫酯键,将泛素分子与蛋白质解离,保护蛋白质不被水解。泛素特异性蛋白酶家族(USPs)是目前最大的去泛素化酶家族,USP7属于半胱氨酸蛋白酶,是USPs的成员之一,也是近些年研究最广泛的成员,最初发现USP7与单纯疱疹病毒ICP0蛋白[3]有关,因此也被称为HAUSP,后来研究表明USP7能够调节细胞中许多蛋白质底物的活性和功能,其中包括抑瘤蛋白、免疫应答蛋白、DNA修复蛋白、病毒蛋白等,因此抑制USP7在疾病治疗的发展中有着重要的地位。
- USP7结构与功能:
USP7具有多个功能结构域[4],分别为N-末端区域、催化区域、C-末端区域。其中N-末端区域可与EBNA1、HDM2、HDMX、P53结合,此区域包含MATH结构域,有助于与蛋白质之间的结合;催化区域有三个保守结构域:Fingers、Palm、Thumb,同时具有高度保守的Cys、Asp(Ⅰ)、His、Asn/Asp(Ⅱ)序列,这是去泛素化酶特有的氨基酸序列;C-末端区域有ICP0结合位点,最近研究发现C-末端位点对维持USP7催化活性有重要作用;在N端和C端分别有一个PEST序列,与蛋白泛素化降解有关。
- USP7抑制剂:
自2000年以来,对USP7小分子抑制剂的研发一直非常热门,相继报道了许多USP7小分子抑制剂。迄今主要发现6类小分子USP7抑制剂,分别为氰基茚并吡嗪类、吡咯酮类、9-氯四氢吖啶酰胺类、噻吩类、2-氨基-4-乙基吡啶衍生物以及喹唑啉-4-酮衍生物。其中氰基茚并吡嗪类衍生物HBX41108是第一个USP小分子抑制剂,但是至今尚未有USP7抑制剂进入临床试验,这是因为这一期间文献和专利报道的USP7抑制剂活性不强,而且大部分没有选择性,而导致这些问题的原因有二[5]:(1).缺乏USP7与小分子抑制剂的晶体复合物,使得开展针对性强的设计和改造工作变得十分困难,从而导致抑制剂活性普遍较低;(2).DUBs家族中成员很多,其中许多同源蛋白的结果高度相似,所以USP7抑制剂的开发非常不容易。
2017年发表的一些文章[6] [7]报道了许多具有全新母核、高亲和力、高特异性的USP7小分子抑制剂,如FT671、FT827、GNE6640、GNE6776、XL188等,由FORMA Therapeutics公司设计的两种含有嘧啶酮结构的化合物[17] FT671和FT827如Fig 1所示。其中非共价抑制剂FT671和共价抑制剂FT287在乳腺细胞中可以抑制USP7,而不影响其他的DUBs的作用,通过降低细胞内MDM2水平,进而升高p53的水平,从而达到抑制癌症的作用。除此之外这些研究还首次获得了一系列USP7和小分子抑制剂的复合物晶体结构,这意味着USP7抑制剂的研究进展取得了突破性成就。在USP7晶体结构基础上再借用NMR技术验证,可以很快进入临床试验阶段,用于肿瘤的治疗。
2.1氰基茚并吡嗪类
HBX41108是氰基茚并吡嗪类的代表,结构式如图2[1],作为第一个USP7抑制剂有许多不成熟的地方,HBX41108选择性差,除了对USP7有抑制作用外,对USP8也有较强的抑制作用。对HBX41108进行结构修饰,结构式[8]如Fig 2,发现其构效关系:(1).将8位引入-CH3的同时,苯环7位Cl原子换成F原子活性保持;(2).7、8位同时用-OCH3取代,活性降低;(3).6位用-F或-CH3取代活性降低,用-OCH3取代活性消失;(4).3位-CN是活性必需基团,换成其他基团活性都会消失;(5).9位羰基变成肟基后,活性由苯环上取代基决定;(6).苯环7位无取代时,活性消失;(7).7位的Cl原子换成F原子活性下降十倍,而换成-OCH3或-OH活性消失。
2.2吡咯酮类
吡咯酮类小分子USP7抑制剂中,与氮连接的侧链苯环的双取代化合物活性强于单取代化合物,并且卤素取代的苯环活性最强,吡咯酮类化合物对USP7具有一定的选择性,它对USP7的抑制作用比其他DUBs成员强几十倍,结构式[9]如Fig 3。
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