一、解决的问题:血清胆固醇水平增高是诱发冠心病、 动脉粥样硬化等心血管疾病的重要危险因子。
胆固醇在肝细胞中经一些列酶促反应形成胆汁酸,是人体内胆固醇的主要去路。
胆汁酸代谢循环的生物通路涉及肝脏及肠道中的多种酶,了解并总结这些酶的结构及性质对深入研究胆固醇代谢有着重大意义。
本课题是先从大量阅读文献入手,充分了解并总结胆固醇代谢的生物通路及涉及的多种酶,再根据已有报道,各蛋白数据库对这些酶蛋白结构和信息进行归类总结,建立蛋白库。
最后通过同源模建和分子对接等手段探讨这些酶的活性差异,从而对胆固醇代谢有更全面深入的理解。
二、研究手段蛋白库建立:以PDB数据库为基础,结合同源模建,对蛋白进行汇总归纳形成数据库。
同源模建:同源建模又称为比较建模,其原理是序列相似则结构相似,即存在同源关系的两条序列具有相似的结构。
当两条序列的同源性大于30%时,序列的同源性能够暗示两者结构相似,序列的同源性越高则结构模型的准确性越高。
分子对接:分子对接是通过受体的特征以及受体和药物分子之间的相互作用方式来进行药物设计的方法。
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