FTO共价抑制剂的结构研究文献综述

 2022-12-29 06:12

FTO共价抑制剂的结构研究1. 研究目的1.1学习并熟练掌握蛋白质的表达纯化,生化活性表征以及结构生物学的基本实验操作1.2 通过复合物蛋白质的晶体学实验来初步确定FTO共价抑制剂与蛋白质的结合方式,为后续设计合成更好的FTO共价抑制剂提供一定的提示。

1.3 了解有关表观遗传学以及RNA甲基化修饰的最新研究进展。

2. 研究内容2.1探究FTO表达和纯化的基本条件2.2对待测化合物进行生物化学assay研究2.3利用有活性的小分子与FTO进行共结晶的条件以及晶体结构的探究3. 研究手段微生物学技术,蛋白质提取及纯化,晶体学技术4. 主要成果形式开题报告,文献综述,毕业论文5. 主要参考文献5.1 J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 17963-17971.5.2 Nucleic Acids Res. 2015, 43, 373-384.5.3 J. Am. Chem. Soc. 2015, 137, 13736-13739.6. 工作进度2018.3-2018.4 进行文献调研以及基本实验操作的学习2018.4-2018.5 进行课题实验的操作执行2018.5-2018.6 进行毕业论文的撰写7. 文献综述RNA作为一种重要的遗传信息载体,存在于众多的生物体中,其根据结构功能的不同主要分为三类,即tRNA、rRNA和mRNA,同时还有许多种类和功能不同的小型RNA,在生命的遗传进化等过程中起到非常重要的作用。

随着科技发展,RNA上的众多修饰被逐渐的发现,对于mRNA的修饰,除了我们众所周知的5帽和3尾巴之外,还发现了位于mRNA内部的许多修饰方式,其中就包括了在mRNA和lncRNA中最丰富的6位N甲基化(m6A)1。

哺乳动物mRNA的m6A的产生是由METTL3和METTL14形成的异二聚体催化的,并且以WTAP和KIAA1429作为辅助因子2-3。

随着下一代测序的产生和发展,使得获得mRNA和lncRNA的全转录组修饰位点图谱成为现实。

m6A主要分布于编码区和3非翻译序列中,RNA的甲基化修饰对基因的表达有十分重要的作用,比如调控pre-RNA和miRNA的进程,翻译的起始,以及mRNA的降解1。

m6A能够召集复制起始因子3(eIF3)和含有YTH结构域的蛋白质,在其中,与eIF3的相互识别作用还不清楚,也没有确定相互作用的关键结构域,与此不同的是,YTH蛋白质通过一种可以被特异性表征的结构域与m6A识别4。

除了写入甲基化外,通过已修饰的RNA的自身降解或者m6A的去甲基化酶都能够使得m6A能够从转录组中被移除。

通过甲基化和去甲基化过程,实现了对基因表达的动态调控。

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