1.课题目的
本课题拟通过蛋白质组学方法，研究血清蛋白质变化及其在肿瘤诊断和预后的应用。通过调研文献，学习并总结目前蛋白质组学方法，以及其在血清蛋白质研究中的应用。学习并掌握初步的蛋白质组学分析技术，利用重组表达系统，表达和纯化2种不同的蛋白质，建立PRM方法的标准样品及定量方法。
2.文献综述
肺癌是危害人类生命健康的主要恶性肿瘤之一。目前，肺癌仍是世界范围内肿瘤患者死亡的首要原因。而我国肺癌发病率位居癌症死亡原因首位，且呈现不断攀升趋势。
肿瘤标志物（tumor markers, TMs）是一类在肿瘤发生、发展过程中，由肿瘤细胞所产生和分泌并释放到血液、体液、组织中反映肿瘤存在和生长的一类物质。好的肿瘤标志物应具有较高的灵敏度和特异性，不但有助于癌症的早期诊断、病理类型的判断和癌症分期，更重要的是能够评估治疗效果和预后并指导个体化治疗。
化疗是大多数肺癌患者的标准治疗方法，而只有少数晚期非小细胞肺癌( NSCLC) 患者化疗有效，所以通过生物标志物评估肺癌患者化疗治疗的预后尤为重要。目前应用于临床的血清肿瘤标志物主要有神经元特异性烯醇化酶（neuron-specific enolase, NSE）、胃泌素释放肽前体（pro-gastrin-releasing peptide, ProGRP）、细胞角蛋白19片段（CYFRA 21-1）、组织多肽抗原（Tissue Polypeptide Antigen, TPA）、鳞状细胞癌相关抗原（squamous cell carcinoma related antigen, SCC-Ag）和癌胚抗原（carcinoembryonic antign, CEA）。
蛋白质组( proteome ) 是指由一个基因组( genome) 或一个细胞或组织表达的所有蛋白质，也可以指细胞或组织、机体全部蛋白质的存在及活动方式。而蛋白质组学（Proteomics）是一门在器官、组织、细胞和亚细胞水平上研究完整蛋白质组表达、翻译后修饰以及蛋白质间相互作用的学科。
蛋白质组学的发展有赖于一整套技术，这些技术按照其流程主要包括蛋白质分离技术，蛋白质鉴定技术，蛋白质鉴定技术，蛋白质间的相关作用分析技术。蛋白质分离技术主要是电泳，其中应用最多的是双向电泳技术（two －dimensional gel electrophoresis，2DE）。对目的蛋白的筛选通常与双向电泳连用，主要采用Western 印迹和差异蛋白比较分析。质谱是蛋白质鉴定的主要技术，包括一级质谱，二级质谱等。蛋白质间相关作用分析技术主要有酵母双杂交系统( yeast two hybrid system)和表面等离子共振( surface plasmon resonance，SPＲ)技术。
现有的蛋白质组定量分析主要基于双向电泳（Two-dimensional electrophoresis，2-DE）和质谱（Mass spectrometry，MS）两大类技术，近 10 年来随着高精度生物质谱技术和数据处理技术的快速发展，基于质谱的蛋白质组定量技术已成为主流的分析手段。
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