开题报告内容:(包括拟研究或解决的问题、采用的研究手段及文献综述,不少于1500字)
拟解决问题:
ALK及ROS1是肺癌中最为常见的融合基因,其检测对于肺癌的靶向治疗至关重要。部分常见融合亚型缺乏可用的商业化细胞系,而临床样本又往往难以长期稳定获取足量的样本量。ALK及ROS1融合分子水平的实验室检测质量控制,或相关产品的开发,均需要有更好的工具。
研究方法:
1)根据人类EML4-ALK融合基因序列,合成EML4-ALK融合基因变体2(V2)和及ROS1最常见融合形式CD74-ROS1
2)采用常规分子生物学方法(EcoR I, BamH I)将携带有目的片段的序列构建在真核表达质粒载体pIRES2-EGFP载体中
3)酶切验证插入片段长度,Sanger测序鉴定。
4)将携带目标片段的质粒转染进入293T细胞中,瞬时转染48h后,提取总RNA,进行RT-PCR表达验证。
文献综述:
肺癌是全球最常见的恶性肿瘤,目前,约有10种驱动基因在肺腺癌中被发现,临床使用针对这些驱动基因的分子靶向治疗药物,使肺癌的治疗和生存期的延长取得了显著进展,因此寻找更多新的治疗靶点成为当今肺癌研究的热点。针对EGFR、ALK融合基因的靶向抑制剂吉非替尼、厄洛替尼、克唑替尼目前已经广泛应用于NSCLC临床治疗。酪氨酸融合激酶是白血病以及实体瘤癌基因的一种重要亚型,1960年Ph染色体(BCR-ABL融合基因)是最早发现的累及受体酪氨酸激酶而致病的重组基因,伊马替尼针对BCR-ABL融合基因的靶向治疗在慢性髓性白血病治疗领域获得巨大成功,使其成为靶向治疗最成功的范例。随着融合基因的不断发现,我们对融合基因的关注不仅仅局限在血液病,更多的实体瘤也被融合基因驱动。原癌基因EGFR和k-ras在NSCLC患者中的突变率分别为约30%和10%(亚洲人群),大规模的DNA测序确定PI3KCA、ERBB2、BRAF在NSCLC患者中的突变率共为5%,超过40%的NSCLC的驱动基因尚未发现。现融合基因被确定为NSCLC的新亚型,ROS1、RET等基因的重排不断报道表明,融合基因在致癌中的重要作用。
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