一个针对干细胞因子Oct4的shRNA的重组质粒构建与验证文献综述

 2022-12-10 03:12
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开题报告内容:(包括拟研究或解决的问题、采用的研究手段及文献综述,不少于2000字)

  1. 拟研究的问题

Oct4属转录因子POU家族成员,它在维持胚胎干细胞的增殖与分化潜能方面起关键作用。近来研究发现,Oct4在乳腺癌、肺癌等多种实体瘤中有表达,其功能可能与肿瘤干细胞紧密有关。

shRNA包括两个短反向重复序列,中间由一茎环(loop)序列分隔的,组成发夹结构,通过RNA干扰的原理靶使基因沉默。通过设计Oct4-shRNA,构建表达载体,达到将肿瘤细胞中Oct4沉默的目的。

因此,本实验先要设计针对Oct4的shRNA,构建表达载体,最后进行功能验证,为肿瘤干细胞研究奠定基础。

二.实验目的

本实验主要通过构建针对Oct4的shRNA的表达载体,并进行功能验证,为肿瘤干细胞研究奠定基础。

三.材料和仪器:

1. 样品和标准品

Oct4-shRNA表达质粒pGPU6-RFP

本实验室制备

2. 材料和试剂

胰蛋白酶

Biosharp公司

DMEM

Gibco公司

EDTA

南京化学试剂有限公司

十二水合磷酸氢二钠

西陇化工股份有限公司

NaCl

西陇化工股份有限公司

乙醇

国药集团化学试剂有限公司

娃哈哈纯净水

杭州娃哈哈百立食品有限公司

3. 实验仪器

CO2细胞培养箱

美国Thermo公司

倒置显微镜

上海测维光电技术有限公司

超净台

苏州净化设备有限公司

电子天平(d=0.01mg)

Sartorius BT25S

数显恒温水浴锅

国华电器有限公司

离心机

上海安亭科学仪器制造厂

PCR仪

My geneTM Series Peltier Thermal cycler

超纯水制造仪

成都超纯科技有限公司

凝胶成像仪

南京麦高德生物科技有限公司

电泳仪

六一

四.实验方法

按照shRNA设计原则,合成Oct4-shRNA,连入shRNA表达载体pGPU6-RFP,转入感受态细胞并进行阳性筛选,提取质粒进行验证。

验证方法:

1.重组质粒测序验证序列的正确性

2.免疫荧光验证重组质粒能否在细胞内表达

3.RT-PCR在mRNA水平验证shRNA表达质粒有没有发挥沉默Oct4mRNA表达

4.Western Blot在蛋白水平验证shRNA表达质粒能否沉默Oct4蛋白的表达

五.文献综述

Oct4基因结构及功能简介

[摘要] Oct4基因是POU转录因子家族中的一员,主要表达于胚胎干细胞、生殖干细胞以及未分化胚胎癌中,对于维持干细胞的多潜能性和自我更新能力具有极其重要作用。本文简要介绍了Oct4的基因结构以及在胚胎干细胞和癌症发生中的作用,为了解Oct4提供便利。

[关键词]:Oct4;胚胎干细胞;肿瘤干细胞;多能性

哺乳动物在胚胎发育过程中受着多种基因的严密调控,以保证其有序地进行组织分化和个体发育。Oct4基因就是其中一个关键基因,也被称为Oct4、POU5F1、OTF3或OTF4,是POU转录因子家族中的一员。近来研究发现,Oct4在乳腺癌、肺癌等多种实体瘤中有表达,并认为其功能可能与肿瘤干细胞有关。

1.Oct4基因结构

人的OCT4基因位于6号染色体上(6p21.31),长度为16.40 kb,具有多个转录起始位点,转录不同的mRNA亚型,从而翻译成多种蛋白质。目前人Oct4基因共有11种亚型,翻译7种蛋白质。OCT4 Isoform 1是转录的主要亚型之一,具有5个外显子、4个内含子,翻译的蛋白质含有一个保守的DNA结合结构域——POU结合域,它能与含八聚体基序(octamer motif)的DNA结合从而调控下游靶基因的转录[1]

2.Oct4的功能

2.1在维持和重获细胞多潜能性中的作用

多能性,细胞在哺乳动物植入前胚泡的内细胞团以及胚胎干细胞的特征,即指一个细胞能够产生一种生物体所有类型的细胞的能力。转录因子家族对于建立和维持多能性状态是很必要的。最近研究已经表明,已分化的体细胞通过一系列转录因子的过表达能够重新获得多能性,进一步显示出转录因子在控制细胞多能性方面的重要性。在这些因子中, Oct4,是控制多能性的重要部分。Oct4高表达于多能性细胞中而在已分化细胞中沉默。有趣的是,Oct4表达的精确水平决定了胚胎干细胞的命运。因此,为了控制Oct4表达的精确性,进行了各个水平上的多种调控,包括转录,mRNA翻译以及翻译后修饰。此外,与SOX2, Nanog的和核心转录调节通路中的其他成员合作, Oct4激活蛋白质编码基因和多能性必需的非编码RNA。同时,与转录抑制复合物共同作用,Oct4抑制其他一系列与发育过程有关的靶点。重要的是,Oct4可以重新建立体细胞的多能性, Oct4表达的正确再编码对于获得真正的诱导多功能干细胞系必不可少[3]。在过去的几年里,Oct4靶基因的全基因组鉴定和以Oct4为中心的蛋白质相互作用组已经被报导,指出Oct4严格控制多能性调控表达和保护胚胎干细胞处于未分化状态[4]。然而,进一步研究要求对Oct4维持和重获多能性作用潜在的分子机制进行充分阐述。对该蛋白质复合物和与Oct4有关的靶基因进行系统性及动态探索将会有助于更全面地阐明Oct4的作用。

体外研究发现,Oct4随着组织细胞的分化其表达降低或消失。此外,通过沉默Oct4基因,鼠和人胚胎干细胞会向滋养层细胞分化,这种维持胚胎干细胞多潜能性的功能是剂量依赖性的[2]。研究发现,Oct4基因表达量的升高或降低,都会引起胚胎干细胞的分化,而且这种调节是极其精细的,小于2倍基础量可以使胚胎干细胞分化成滋养外胚层细胞,大于2倍的基础量可以使胚胎干细胞分化成中胚层细胞。

2.2 Oct4在肿瘤中的作用

研究发现胃癌、神经胶质瘤、肝癌、卵巢癌、肺癌及膀胱癌等多种肿瘤中均有oct4的表达,维持肿瘤细胞的未分化性和自我更新潜能,参与肿瘤的形成与进展。作为胚胎干细胞的特异性基因,Oct4主要表达于胚胎和生殖细胞肿瘤中,如睾丸生殖细胞瘤、精原细胞瘤、胚胎性癌和胚胎癌细胞系中。部分研究者在非生殖系统肿瘤细胞和组织,如胰腺癌Capan-2、Pan-1细胞系、肝癌Mahlava细胞系、宫颈癌HeLa细胞株、人乳腺癌MCF-7细胞系以及乳腺癌组织和膀胱癌组织中也检测到了Oct4的表达[2]。有研究发现oct4的表达与卵巢上皮性肿瘤的进展有关,从良性浆液性腺瘤进展至交界性浆液性腺癌和恶性浆液性腺癌时oct4的表达逐渐增强,并且其表达程度与肿瘤的分期有关,黏液性腺癌中的表达情况与浆液性肿瘤相似,但与肿瘤的分期没有相关性。

3.展望

近年来随着干细胞的研究越来越热,Oct4基因因此也被重视,此外Oct4在肿瘤干细胞的高表达也提示Oct4可能会成为肿瘤治疗的新靶点。我们相信随着Oct4研究的不断深入会在胚胎发育及肿瘤治疗方面取得更大进步。

[参考文献]

[1]郑鹏生,曹浩哲. Oct4基因的研究进展[J]. 西安交通大学学报(医学版),2010,05:521-526.

[2]黄灵,郜峰,张声. Oct4在肿瘤发生发展中的作用[J]. 国际病理科学与临床杂志,2013,01:78-81.

[3]Guangming Wu1 and Hans R Schouml;ler. Role of Oct4 in the early embryo development [J]. Cell Regeneration. 2014, 3:7

[4]Guilai Shi, and Ying Jin. Role of Oct4 in maintaining and regaining stem cell pluripotency [J]. Stem Cell Research and Therapy. 2010, 1.39.

开题报告内容:(包括拟研究或解决的问题、采用的研究手段及文献综述,不少于2000字)

  1. 拟研究的问题

Oct4属转录因子POU家族成员,它在维持胚胎干细胞的增殖与分化潜能方面起关键作用。近来研究发现,Oct4在乳腺癌、肺癌等多种实体瘤中有表达,其功能可能与肿瘤干细胞紧密有关。

shRNA包括两个短反向重复序列,中间由一茎环(loop)序列分隔的,组成发夹结构,通过RNA干扰的原理靶使基因沉默。通过设计Oct4-shRNA,构建表达载体,达到将肿瘤细胞中Oct4沉默的目的。

因此,本实验先要设计针对Oct4的shRNA,构建表达载体,最后进行功能验证,为肿瘤干细胞研究奠定基础。

二.实验目的

本实验主要通过构建针对Oct4的shRNA的表达载体,并进行功能验证,为肿瘤干细胞研究奠定基础。

三.材料和仪器:

1. 样品和标准品

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